数据库
ncbi可以检索的数据库包括?
一、ncbi可以检索的数据库包括?
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,提供了多个生物信息学和生物医学数据库,以下是一些NCBI可以检索的主要数据库:
1. PubMed:包含生物医学和生命科学领域的科学文献摘要和全文。
2. GenBank:一个DNA和RNA序列数据库,记录了来自不同生物种类的基因组序列。
3. Protein:包含蛋白质序列和结构信息的数据库。
4. GEO(Gene Expression Omnibus):一个基因表达数据的存储库,包括多种生物实验和高通量测序数据。
5. dbSNP:一个记录常见和罕见的单核苷酸多态性(SNP)的数据库。
6. SRA(Sequence Read Archive):存储了高通量测序(NGS)产生的原始测序数据。
7. ClinVar:一个与人类遗传变异相关的数据库,包含与疾病和基因变异相关的临床信息。
8. Nucleotide:包含DNA和RNA序列数据的存储库,是GenBank的组成部分之一。
以上只是一些主要的NCBI数据库,还有其他数据库,如PubChem、Structure等,涵盖了生物医学、基因组学、生物信息学和生命科学等多个领域。这些数据库可用于生物学和医学研究,以及生物信息学和基因组学等领域的数据检索和分析。
二、ncbi主要是用来检索什么的?
ncbi主要是用来检索医学和生物学相关的英文文献,其他语言的文献无法用ncbi 检索。
三、ncbi是什么数据库?
NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心,建立于1988年。NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统,除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。
四、数据库检索优点?
优点是:开发简单,而且不用额外部署新的系统。
全文检索。基于“体恤衫”这类文字信息的模糊匹配。文字信息是非结构化的数据,这类检索的通常原理是将文字内容进行分词,然后在通过事先扫描商品信息建立好的倒排索引进行匹配。这类搜索和数据库的机制没有什么交集,数据库基本上不能做这类任务(有一些扩展包可以让数据库支持全文检索,但不普及不高效)
基于分类tag的精确匹配。这类检索属于结构化数据的精确匹配。数据库是可以完成的。多条件的筛选一般也会基于join来做。数据量小的时候没有什么问题。但是如果数据量很大,由于数据库使用的是声明式的SQL语言,查询过程基本上是没有办法控制的。性能上优化起来并不是很容易。所以很多公司也会采用一些其他的方案。
综上,数据库在搜索这样的任务上谈不上擅长,小数据量的时候还可以勉强胜任。
五、探寻科学的宝库:全面解读NCBI数据库
什么是NCBI数据库
NCBI,全称National Center for Biotechnology Information,中文名为美国国家生物技术信息中心,是一个致力于生物技术领域研究的综合性数据库。
NCBI数据库的内容
NCBI数据库涵盖了大量生物学、生物化学和生物技术相关的数据和文献,包括基因序列数据库、生物学文献数据库、蛋白质数据库等。
主要数据库介绍
NCBI的主要数据库包括:
- GenBank:包含已知的DNA序列,是世界上最大的基因序列数据库之一。
- PubMed:包含了生物医学文献和期刊文章,是生命科学领域重要的检索平台。
- BLAST:是用于核酸或蛋白质序列分析的工具,可用于序列比对、寻找同源序列等操作。
NCBI数据库的应用
NCBI数据库在科研领域有着广泛的应用,包括基因注释、序列比对、新基因的发现、蛋白质结构预测等领域。
数据共享和开放获取
NCBI数据库提倡数据的共享和开放获取,任何科研人员都可以免费使用和下载其中的数据,推动了科学研究的进步。
通过NCBI数据库,科研人员可以获得全球范围内的生物信息学数据和文献资源,为生命科学研究提供了强大的支持和帮助。
感谢您阅读本文,希望能帮助您更好地了解NCBI数据库,为您的科研工作或学习带来帮助。
六、oracle数据库的全文检索?
Oracle全文检索配置方法:
1.检查数据库是否具有全文检索功能(这是针对已经建成使用的数据库)
查看用户中是否存在ctxsys用户,查询角色里是否存在ctxapp角色。以上两个中的1个不满足(不存在),则说明没有装过全文检索功能。
使用contains函数的时候,若没有全文检索则会报错的。
2.若没有,则需要手动建立,先建立全文检索要使用的空间
sqlplus / as sysdba --进入控制台
create tablespace Idx_ctxsys datafile '/oradata/sg186fx/ctxsys01.dbf size 10240M autoextend on next 32M maxsize 20480M;--创建全文检索使用的表空间
3.创建全文检索使用的用户和角色及相应的包,则需要执行oracle自带的一个脚本:cd $ORACLE_HOME/ctx/admin/catctx.sql
还是在sqlplus中执行:
@?/ctx/admin/catctx.sql ctxsys Idx_ctxsys temp nolock
在执行这个脚本的时候,输入了几个参数,第一个参数ctxsys为ctxsys用户的密码
第二个参数Idx_ctxsys为ctxsys用户要使用的表空间
第三个参数temp为ctxsys用户使用的临时表空间
第四个参数nolock为ctxsys用户处于解锁状态。
4.创建完成后,要登录ctxsys用户
connect ctxsys/ctxsys
执行以下脚本:@?/ctx/admin/defaults/drdefus.sql(这是个很重要的脚本,后面创建索引会使用该脚本创建的信息)
5.创建全文索引语法分析器
先要明确使用全文索引的用户,我要使用全文索引的是sgpm用户
因此
grant execute on ctxsys.ctx_ddl to sgpm with grant option;
connect sgpm/sgpm
设置语法分析器:
exec ctx_ddl.drop_preference('chinalexer');exec ctx_ddl.create_preference('chinalexer','chinese_lexer');
设置词法属性:
exec ctx_ddl.drop_preference('idx_c_store');
beginctx_ddl.create_preference('idx_c_store','BASIC_STORAGE');ctx_ddl.set_attribut('idx_c_store','I_TABLE_CLAUSE','tablespaces Idx_ctxsy');ctx_ddl.set_attribute('idx_c_store','I_INDEX_CLAUSE','tablespace Idx_ctxsy compress 2');end;/
6.创建索引
create index sgpm.idx_c_cons_name on sgpm.c_cons(cons_name) indextype is ctxsys.context parameters('lexer chinalexer storage idx_c_store');
7.同步索引
variable jobno number;begindbms_job.submit(:jobno,'pkg_sp_tools.p_cont_sys_index();',sysdate,'trunc(sysdate)+19/24+1'); --执行的是个性化方法。end;/
普通的就是用:
exec ctx_ddl.sync_index('idx_c_cons_name');
到此,全文检索创建成功,contains函数就可以正常使用了。
注意:创建的过程中会出现ORA-29879:cannot create multiple domain index on a column listusing same indextype ,这说明在其他用户下已经建立了该索引。
七、wiley数据库的检索方法?
1 快速检索
提供了类似搜索引擎的检索方式,用户只需要输入所要找的关键词,点击“快速检索”就查到相关的文献。
2 标准检索
在标准检索中,将检索过程规范为三个步骤:一输入时间、支持基金、文献来源、作者等检索控制条件;二输入文献全文、篇名、主题、关键词等内容检索条件;三对检索结果的分组排序,反复筛选修正检索式得到最终结果。
3 专业检索
使用逻辑运算符和关键词构造检索式进行检索,用于图书情报专业人员查新、信息分析等工作。
八、中国数据库检索的方法?
1 快速检索
提供了类似搜索引擎的检索方式,用户只需要输入所要找的关键词,点击“快速检索”就查到相关的文献。
2 标准检索
在标准检索中,将检索过程规范为三个步骤:一输入时间、支持基金、文献来源、作者等检索控制条件;二输入文献全文、篇名、主题、关键词等内容检索条件;三对检索结果的分组排序,反复筛选修正检索式得到最终结果。
3 专业检索
使用逻辑运算符和关键词构造检索式进行检索,用于图书情报专业人员查新、信息分析等工作
九、检索数据库怎么填?
就是你这篇文献是通过哪个数据库检索出来的?比如说通过万方知网等等
十、通俗解释 数据库检索?
数据库说白了,就是存储数据的仓库,所有的数据都可以往里面存,图片、音乐、视频、文本等,它应用于我们生活的各个领域,最常见的,我们的手机里面,电话 本,短信,都是存在一个库里面,平时使用的QQ聊天工具,所有的好友,聊天记录都是存在库中的,这也就是所谓的数据库,我们使用的操作系统,也是一个文件 库,现在的网游、网站、软件、办系统,都离不开数据库的支撑,只不过通过特殊的设置和安排,让不同身份的操作者,执行对数据库不同的操作权限,你提问题, 是向数据库里面写一条记录,同时显示到前端Web界面,我来回答也是对应您的问题也同时往数据库中写一个答案,数据库就是如此神奇
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