python
fastq默认几个线程?
一、fastq默认几个线程?
QC报告的输出目录,默认输出fastq文件的相同目录下,输出结果有.html和.zip两个文件使用线程数,每个线程占用250M内存,不要超过机器的可用内存,32 bit机器不能使用超过6个线程
二、fastq文件如何生成?
例如通过序列拼接将fastq转换为fasta,通过短序列比对将fastq与fasta合并为bam,通过变异检测将bam中突变位点提取出来转换为vcf
三、fastq.gz用什么打开?
gz为扩展名的是一种压缩文件,在Linux和OSX下常见,Linux和OSX都原生支持.gz格式文件,双击即可打开使用这种压缩文件。
Windows可以使用常见的解压缩软件WINRAR、WINZIP、7-Zip、好压解压。
以WINRAR解压为例:选择.gz格式文件,右键——解压。即可解压.gz格式文件。
四、fastq文件怎么在电脑里打开?
其实gedit可以打开fastq文件,只是因为3G文件太大gedit就有点力不从心了,可以写个小程序跑截取部分,这样文件变小就可以用gedit打开
五、python?
Python是一种跨平台的计算机程序设计语言。 是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。最初被设计用于编写自动化脚本(shell),随着版本的不断更新和语言新功能的添加,越多被用于独立的、大型项目的开发。
它还有一个很惊人的中文名,叫蟒蛇。
六、python和python的区别?
python和python这2个是一样的,并没有区别。
很显然,两个一样的物品或者内容并不存在不同,提问的第一个元素与第二个元素是一模一样,本质上讲就是一个东西、一件事情。
建议把前后两个要做对比的元素描述清楚,比如python2.X和Python3.X有什么区别,才能正确结论。
七、python为什么叫python?
自从20世纪90年代初Python语言诞生至今,它已被逐渐广泛应用于系统管理任务的处理和Web编程。
Python的创始人为荷兰人吉多·范罗苏姆 [4] (Guido van Rossum)。1989年圣诞节期间,在阿姆斯特丹,Guido为了打发圣诞节的无趣,决心开发一个新的脚本解释程序,作为ABC 语言的一种继承。之所以选中Python(大蟒蛇的意思)作为该编程语言的名字,是取自英国20世纪70年代首播的电视喜剧《蒙提.派森的飞行马戏团》(Monty Python's Flying Circus)。
八、fastq文件怎么把大于200bp的提取出来?
通过序列拼接将fastq转换为fasta,通过短序列比对将fastq与fasta合并为bam,通过变异检测将bam中突变位点提取出来转换为vcf。
九、Python Python语句list(range(1?
python2.x中,range返回的是一个列表
python3.x中,range返回的是一个迭代值
类似forninrange(1,10):之类的可以照常使用
如果要在3.x中产生1-10的列表,可以list(range(1,10))~~
十、python pyw需要python环境吗?
需要。只有完成打包好的exe文件才能脱离python环境,独立运行。
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