mirna模板是什么？

一、mirna模板是什么？

miRNA（microRNA）是一类短小的非编码RNA分子，通常由70-100个核苷酸组成。miRNA参与调控基因表达，能够通过与mRNA靶标结合，诱导靶标的降解或者抑制靶标的翻译，从而调控基因表达水平。miRNA模板指的是用于合成miRNA分子的DNA模板序列。

miRNA的合成一般分为两步：首先，由DNA模板产生一个名为pri-miRNA（primary miRNA）的前体分子，该分子在细胞核中由RNA聚合酶II依据miRNA的编码基因转录而来；其次，pri-miRNA通过一系列的酶切和加工步骤被转化成成熟的miRNA分子。

在pri-miRNA被加工为成熟miRNA的过程中，存在一个重要的步骤，即剪切和去除pri-miRNA上的miRNA模板。miRNA模板通常位于pri-miRNA分子的一个特定区域，可以通过两端的酶切作用来剪切和去除。剪切产生的miRNA分子会形成 RNA-Induced Silencing Complex (RISC) 或其他相关复合物，从而与mRNA靶标进行特异性结合，发挥调控基因表达的功能。

miRNA模板的序列对于miRNA的合成和功能至关重要。它决定了miRNA分子的亲和性和特异性，即决定miRNA与哪些mRNA靶标能够结合。研究人员通过对miRNA的模板序列进行分析和比较，可以揭示miRNA与靶标基因之间的相互作用和调控网络，从而深入理解miRNA对基因表达的调控机制。

二、什么是Mirna？

mirna是：微RNA（microRNAs，又译小分子RNA）是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个核苷酸的RNA分子，可调节其他基因的表达。

miRNA来自一些从DNA转录而来，但无法进一步转译成蛋白质的RNA（属于非编码RNA）。

miRNA通过与靶信使核糖核酸(mRNA)特异结合，从而抑制转录后基因表达， 在调控基因表达、细胞周期、生物体发育时序等方面起重要作用。

在动物中，一个微RNA通常可以调控数十个基因。

三、miRNA mimics和miRNA agomir的区别在哪里？

miRNA mimics是针对miRNA的成熟体设计并合成的小片段双链miRNA.作用与miRNA的成熟体是一样，可以上调细胞内相应miRNA的含量，但结构略有不同，所以并不等于miRNA或成熟体miRNA，国内也叫模拟物。

miRNA agomir是在化学合成的mimics上的基础上，经过特殊的化学修饰升级的产品，不只是更稳定，表达时间长这么简单，可以实现细胞实验，不需要转染试剂，另外，可以直接溶解后用于动物实验。

总之，结构与使用方式与mimics有不同，但作用是一样的，都是使得内源性的miRNA上调。

四、snrna与mirna的区别？

snRNA和miRNA都是属于ncRNA中的small non-coding RNA，snRNA主要参与mRNA的成熟和snRNA的成熟；而miRNA主要是抑制mRNA翻译或诱导mRNA降解；snRNA在结构上通常有SM结合位点，与一系列蛋白形成snRNP，代表有U1~U6 snRNA，主要剪切内含子使mRNA成熟；miRNA一般21~22bp，有种子序列与mRNA互补配对抑制其翻译或诱导其降解，发挥作用时与RISC及AGO等蛋白形成miRNP。

五、mirna海绵是什么？

miRNA海绵（miRNA sponge）是2007年由麻省理工大学的Phillip Sharp及他的同事利用开发出一种长期抑制miRNA基因的高效方法。

miRNA海绵是一条mRNA，其3’ 非翻译区（UTR）包含若干个miRNA靶定位点。主要是利用这些靶定位点在RISC切割位点有一些错配。这样，抑制剂mRNA就不会被降解，而与RISC稳定结合，让它远离天然的mRNA靶点。

因miRNA海绵本质是mRNA,故需由表达质粒编码的。

六、miRNA测序报告里有很多其它物种的miRNA，这种情况怎么处理？

如果其他物种序列所占比例比较高就得考虑是不是样本被污染了，需不需要重新采样送测序；要是比例很低，或者说你不想重新测序，就用工具去除其他物种序列后再进行分析。

七、如何预测lncrna与mirna之间的关系？

有免费的在线数据库可以预测，比如 StarBase，这是一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库，整合多个预测软件，预测miRNA靶基因，包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。

整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。

构建了最全面的包含了14种癌症类型（>6000个样本）Pan-Cancer（泛癌）表达图谱和互作网络。

八、miRNA荧光定量PCR中的内参用什么？

mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参miRNA通过与转录本的相互作用，关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。miRNA在多个组织中差异表达，这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时，miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。我知道和使用过的U6内参基因只有两个：RNU6-1和RNU6-2.前一个就是常见的u6,后一个有时被称为u6b.在我的大鼠RNA样本当中,u6表达量有些太高,u6b的Cq值与我的目标miRNA比较接近,稳定性也很好.但是这些对植物样本中的内参基因选择没有什么指导意义.为了确定u6在植物中的保守性,比较快捷的办法是找到谈论这个话题的文献综述.如果没有人写过这样的综述的话,就只能靠自己去数据库找到所有序列自己对比了.关于内参基因的选择,必须实验确定特定样本中的表达水平稳定,其他文献中报导的内参基因不一定适合你的样本.做新的课题时,选择内参基因一般是选取3-5个常用的,PCR测试后选取.

九、如何筛选一个靶基因的mirna？

利用各种生物信息学方法和实验方法来寻找miRNA的靶基因。

，鉴定miRNA靶基因的最常用方法是依赖计算机算法，如TargetScan、MiRanda和PicTar。它们预测miRNA种子区的结合。种子区（seed region）指的是miRNA上进化最为保守的片段，从第2个到第8个核苷酸，通常与mRNA 3’-UTR上的靶位点完全互补。

十、可以根据目的基因设计合成一段MiRNA序列？

通常的情况是：你已有的基因序列包含有目的基因（但并不是整个的已有序列都是目的基因），并且你根据你所掌握的目的基因的信息来设计引物（比如说你已经知道了目的基因的部分序列），这样再利用PCR技术扩增，即可获得你想要的目的基因，而那些不是目的基因的部分没有得到扩增。

并且在基因克隆技术中，目的就是要获得大量的目的基因，这样才能进行后续的筛选工作。