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怎样对DNA多重序列比对结果分析?
一、怎样对DNA多重序列比对结果分析?
你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧。
进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequencealignment。
给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析。
把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中(一般做同源分析都是用蛋白质序列)。
然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册。如果还有不明白就发信息给我
二、两条基因序列比对用什么方法?
如何用dnaman比对两个基因的序列
所谓重叠基因是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列,或是指一段DNA序列成为两个或两个以上基因的组成部分。
重叠基因有多种重叠方式。例如,大基因内包含小基因;前后两个基因首尾重叠一个或两个核苷酸;几个基因的重叠,几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起,等等。重叠基因中不仅有编码序列也有调控序列,说明基因的重叠不仅是为了节约碱基,能经济和有效地利用DNA遗传信息量,更重要的可能是参与对基因的调控。
三、dna比对原理?
人的细胞中有一半基因来自父亲,另一半来自母亲,所以我们可以通过比较等位基因的差异来鉴定两个人的亲子关系。如果等位基因一致,说明两人有血缘关系,否则没有血缘关系。自从这种方法由奥地利生物学家孟德尔首先提出后,dna比对原理,也称为DNA鉴定原理,就是孟德尔的生物遗传定律。
四、ncbi序列比对步骤?
以下是NCBI进行序列比对,查找相关序列注释的基础用法,
1.打开NCBI网站:National Center for Biotechnology Information
2.点击popular resources的BLAST工具,进入工具主页面。
3.根据自己要进行比对的序列的类型,选择适合的blast。
4.点击blast后,在转跳页面等待一分钟左右,直到弹出信息页面。
5.点击这条序列的accession,即可转跳到genbank中查看这条序列的注释信息。
6.点击这里这条基因的链接,会转跳到gene数据库页面,看到更多的信息。
7.下载这条序列的fasta格式。
五、dna比对寻亲需要多久?
10~15天。
正常情况下亲子鉴定出结果的时间是10~15天左右,那每个亲子鉴定机构出报告的时间可能会有所不一样的,可以选择省级的亲子鉴定机构进行亲子鉴定,准确性相对比较高,那出报告单的时间可能也会相对比较早一些,可以根据自身的具体情况,选择合适的亲子鉴定机构进行亲子鉴定。
六、dna比对寻亲 怎么录入?
dna比对寻亲 操作的过程
1.宝贝回家网注册,发布宝贝寻家,或者家寻宝贝,按照你自己的实际情况来写。
2.发布上去之后会有一个寻亲编号,留上自己的电话,会有宝贝回家的志愿者给你联系,跟进寻亲细节。
申请后页面 会显示有一个自己在寻亲编码
3.询问宝贝回家在志愿者,怎么申请DNA入库。他们会教你怎么操作
找负责自己在志愿者联系 怎么申请DNA入库
4.志愿者会给你发一个公益DNA检测申请表
5.表格必须事实填写,填写好后,发给宝贝回家志愿者,志愿者会把你在资料发给宝贝回家平台的DNA管理人员。
6.宝贝回家的DNA管理人员,收到后会给你发出去一个验血工具。里面有采血的注意事项,有酒精棉签,干棉签,还有扎指针、采样纸。一定要按照采血注意事项操作!
7.找医院医生,或者门诊医生,或者自己在家用棉签消毒后自然晾干,然后扎破手指,把血滴到采样纸板上,一定要按照他们在采血注意事项来。血液自然晾干,不可风干,晒干 注意:采样后的血板不能装到塑料袋里,一定要装到纸袋里。
8.采血注意事项最下面有邮递地址,采血过后,把血液采样纸,还有身份证复印件按手印发快递过去。
最后就等待结果,现在全国都DNA数据库联网了.如果自己寻亲的话,你这边有录入DNA,刚好你的亲人那边也加入了寻亲,那么比对结果就比较快!
七、dna比对技术的优势?
基因芯片的原理是碱基配对。样品通过一条或多条已知序列经过标记的核酸探针进行杂交,通过检测杂交结果而测定样品序列,优点是可以一次分析大量样品,缺点是容易出现假阳性。
基因测序的原理是双脱氧链终止法,用仪器测定一条DNA序列,优点是准确率高,没有假阳性,只是通量略低。
八、真菌序列用什么比对?
答案如下:真菌序列通常使用blast或diamond进行比对。Blast和diamond是最流行的真菌序列比对软件。这些工具能够在数据库中快速搜索并匹配具有相似序列的参考序列。而真菌基因组和转录组具有高度复杂性,而这两种工具提供了强大的比对分析能力,能够对这些复杂性进行分析,从而解释真菌的生物学特征。除了blast和diamond,还有其他的真菌序列比对工具,如HMMER,LAST和Bowtie等。每一种工具都有其相应的优缺点,需要结合实际情况进行选择。比对质量的好坏可以对后续的序列分析和注释产生重大影响,因此选取适当的比对工具非常重要。
九、时间序列分析 python
时间序列分析的重要性及Python实现
时间序列分析是一种在统计学和数据分析中常用的方法,它通过对时间序列数据进行分析,以识别数据的变化趋势、周期性、异常值等特征。随着数据科学的发展,时间序列分析的应用越来越广泛,特别是在金融、医疗、交通等领域。 在Python中,有许多库可以用于时间序列分析,其中最受欢迎的是Statsmodels和pandas。Statsmodels是一个包含大量统计模型的库,而pandas则是一个强大的数据处理库,提供了许多用于时间序列分析的功能。 首先,让我们通过一个简单的例子来介绍如何在Python中使用这些库进行时间序列分析。假设我们有一组股票价格数据,我们可以使用pandas来读取和处理这些数据,然后使用Statsmodels中的ARIMA模型来预测未来的价格趋势。首先,我们需要安装必要的库。可以使用以下命令在终端中安装:
十、python 时间序列分析
时间序列分析概述
时间序列分析是一种用于研究时间序列数据的方法,它可以帮助我们理解数据的变化趋势、周期性、随机性以及其他统计特征。在Python中,有许多库可以用于时间序列分析,如pandas、numpy和matplotlib等。这些库提供了强大的功能,可以帮助我们处理和分析时间序列数据。
Python时间序列分析的应用
时间序列分析在许多领域都有应用,如金融、经济、气象、医疗等。在金融领域,时间序列分析可以帮助我们预测股票价格、市场趋势和风险评估。在医疗领域,时间序列分析可以帮助我们理解疾病的发展趋势和治疗效果。
下面是一个使用Python进行时间序列分析的简单示例代码,我们将使用pandas库来加载和处理数据,并使用matplotlib库来可视化结果。
示例代码
首先,我们需要安装必要的库。可以使用以下命令在终端中安装:
pip install pandas numpy matplotlib
接下来,我们使用pandas库加载数据。在这个示例中,我们将使用一组股票价格数据。首先创建一个CSV文件并命名为`stock_data.csv`,然后插入以下数据:
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